Disciplina Curricular
Bioinformática Bioin
Mestrado Bolonha em Oncobiologia - 1_Despacho nº13536/12 - Desde 2012/13
Contextos
Grupo: 1_Despacho nº13536/12 - Desde 2012/13 > 2º Ciclo > Parte Escolar
Período:
Peso
3.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Os recentes desenvolvimentos da ciência têm produzido uma grande quantidade dados de genómica, proteómica e transcritómica disponíveis publicamente em uma grande variedade de bases de dados de internet. A bioinformática é uma área de rápida evolução e desenvolvimento, tanto em termos de aplicações úteis e como em profundidade do que pode ser realizado. Este curso irá proporcionar aos alunos a formação adequada exigida para utilização de bases de dados e ferramentas de bioinformática. Após a conclusão do curso, o aluno terá capacidade para trabalhar com a grande quantidade de dados das ciências "ómicas" e ferramentas da internet, que serão relevantes para aplicar abordagens que integram uma variedade de dados na sua pesquisa sobre cancro
Programa
Esta unidade curricular irá fornecer uma introdução às ferramentas de bioinformática e métodos de análise. Os alunos vão aprender como encontrar e pesquisar bancos de dados biomédicos contendo informações focadas em genes e ciências "ómicas", como NCBI e Ensembl. Ferramentas de buscas que permitem procuras de vários termos de uma só vez serão também exploradas, como Biomart. Em paralelo, serão apresentadas ferramentas relacionadas com cancro (ex: ONCOMINE). Os alunos irão abordar os mais recentes desenvolvimentos no campo de abordagens “ómicas”, desde os microarrays às técnicas de sequenciação em larga escala. Os conceitos básicos, aplicações e métodos serão apresentados e discutidos para cada tipo de abordagem. Em paralelo, as ferramentas de biologia de sistemas serão abordados, com foco em redes reguladoras de genes e respectivas dinâmicas. Finalmente, a integração de dados das ciências "ómicas" e informação biomédica serão abordados, explorando estudos recentemente publicados.
Métodos de ensino e avaliação
O nosso objectivo é ter um curso tutorial, centrado nos alunos. As unidades curriculares do Mestrado aqui proposto seguem uma metodologia comum. Não duram o semestre inteiro, pelo contrário funcionarão como módulos. Estes módulos são cursos curtos e intensivos (2-3 dias), onde são apresentados e discutidos com os alunos os conteúdos programáticos. A partir daqui os alunos decidem quais os temas que querem aprofundar, e para isso podem sempre recorrer ao grupo de tutores (docentes coordenadores), podendo desde logo começar a pensar e desenhar no seu projecto/trabalho final. No final da unidade há uma avaliação por exame escrito (e se necessário oral). Paralelamente, as unidades de “Journal Club” e “Oncology Series” pretendem integrar os conhecimentos, pelo que nestas a avaliação será através da escrita e/ou revisão de artigos e projectos de investigação. Os alunos têm também de demonstrar que conseguem integrar e utilizar os conhecimentos adquiridos.